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原核生物大肠杆菌基因组序列形成核小体能力的预测
陈冰
,
任松叶
,
赵秀娟
,
蔡禄
The Prediction of E.coli Genome Sequence Form Nucleosome
Chen Bing
,
Ren Songye
,
Zhao Xiujuan
,
Cai Lu
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以大肠杆菌基因组为研究对象,基于体外组装的核小体序列中k-mers频数信息,采用多样性增量结合二次判别算法对核心DNA和连接DNA进行分类预测,整体准确率和相关系数分别达到83.08%和0.619.对大肠杆菌、酵母和人类基因组中核小体定位序列与缺失序列中偏好的k-mers进行了比较,结果表明核小体缺失序列更为保守
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